בהמשך להכרזת מצב החירום ובהתאם להנחיות משרד הבריאות, בתי החולים בילינסון והשרון מקבוצת כללית עברו לעבוד במתכונת חירום. בתוך כך, בילינסון נערך להפעלת בית החולים התת קרקעי והמתחמים הממוגנים אליו מועברות מחלקות ושירותים חיוניים. חדרי הלידה של בית החולים ימשיכו לפעול כסדרם וכך גם המיון הממוגן. חדרי המיון בבילינסון ובשרון ערוכים לכל תרחיש.
בית החולים בילינסון פתח תקווה טיפל מאז תחילת מלחמת "חרבות ברזל" באלפי פצועים, שחלקם עדיין מאושפזים. בית החולים היה גם זה שקיבל אליו את רוב החטופים השבים, שאושפזו בו עם הגיעם לארץ. השבים שהו בבניין הזכוכית החדש. בשל עומס מול עשרות אלפי המפונים מעוטף עזה, פתח בית החולים שלוחה באילת בשיתוף עם יוספטל. בית החולים תירגל את כל צוותי החירום והמחלקות לכוננות גבוהה.
